不论是工业净化厂房装修，还是生物洁净室装修，在计算出各室空调负荷、送风量、回风量、排风量、新风量之后，就需进行空调系统的划分，以满足生产工艺及相关规范的要求。净化车间装修空调系统可按照以下几点进行划分：

  1.按使用时间划分
  任何一个生产工艺，每个生产环节并非同时工作，尽可能将工作时间相同的洁净室纳个系统（这些洁净室的位置相对集中），在非工作时间，该系统可以停止运行，以利节能。
  2.按洁净室内热湿比划分
  尽可能将热、湿比相近的洁净净化车间划分为一个系统，避免出现温湿度偏差太大的缺陷有利于简化系统，省去洁净室末端的冷却或再热的设施。
  3.按温湿度条件划分
  将温湿度要求相同或相近的洁净室构成一个系统，使系统简化，利于节能。
  4.按排风情况划分
  将要求排风或排风量大的洁净室划为一个系统，有利于系统的设计。
  5.按洁净度级别划分

  将洁净度级别100级（209E）及高于100级的洁净室划为一个系统，把低于100级的洁净室划于一个系统，利于温湿度控制。

  6.按工艺性质划分

  将工艺性质相同，不会释放污染物的洁净室集中于一个系统，有利于防止交叉污染。以上的系统划分原则，有时很难同时满足。如应该划为一个系统的洁净室位置太分散也不宜集中在一个系统中。这时可把个别分散的洁净室就近纳入别的系统。这里所讲的系统划分，是针对大的洁净车间，如果净化厂房车间较小，只要行业规范允许使用一个系统，就不必划分，以利于节约机房面积。一般以4万m³/h送风量为限来划分为好。

  当整个净化车间只有很小面积的洁净室是单向流时，只要行业规范允许，也可与非单向流洁净室合为一个系统。采用特殊措施来解决夏季过冷、冬季过热的弊端。这样可使系统简化，节约无尘净化车间机房面积。所以，应灵活应用上述原则，不能生搬硬套。